该院始建于1957年，是山西省中医药领域的最高科研机构，被国家中医药管理局定为全国重点科研院(所) 。
【享誉三晋大地的中医】
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糖尿病研究所(内分泌科)所长尹翠梅作为学科带头人，经过13年的研究探索，采用中西医结合方法治疗糖尿病取得了可喜的成绩，她带领研究所的一班人马，攻克了许多糖尿病治疗中的难题，其中治疗糖尿病合并感染的“泌感散”和降低血糖有较好疗效的“降糖胰复康”均取得了满意的疗效，并获山西省科技进步二等奖 。
肾病研究所(肾病科)是华北地区闻名的肾病治疗中心 。早在20世纪70年代全国首创的活血化瘀治疗肾病的“益肾汤”，为肾病的治疗开辟了道路 。近年来，他们又与临床紧密结合，相继研制出具有专病专治特色的中药制剂10多种 。其中有治疗血尿的“血尿停”，治疗泌尿系感染的“滋阴通淋胶囊”，治疗肾病综合征的“莲慈汤”、“益肾合剂”，治疗慢性肾功能衰竭的“肾衰胶囊”、“肾毒灵”、“结肠透析液”等 。
骨科(山西省创伤骨科研究所)以临床治疗为主，在山西省内首家引进和使用了“板——棍脊柱矫正系统”，该系统能随患儿的生长而自动调整器材长度，既坚实固定，又不限制患儿的生长发育 。另外，他们开展的先天性脊柱纵裂、椎管内畸形骨嵴的治疗取得了满意的效果 。
肿瘤科以中西医结合的综合治疗为主，强调注重对患者个体的改善，采用综合治疗、因人而异的方法，关注肿瘤本身和病人 。他们根据肿瘤患者不同时期的特点，研制了“胃肠瘤消胶囊”、“抗癌肺康胶囊”、“升白颗粒”及“抗突变胶囊”等中药制剂，经大量临床应用证实，对于抗肿瘤、防止复发和转移、防治放疗化疗的毒副作用、增强机体免疫力、提高生存质量、延长生存期等有显著疗效 。特别是通过中药调理，使患者术前能够改善身体状况，扩大手术适应症的范围，术后提高了抗病能力和机体免疫力，有利于早日康复，充分体现出中医药在综合治疗肿瘤中的优势 。
妇科早在20世纪60年代就以首创中药保守治疗宫外孕成功而享誉国内外，他们所创立的“宫外孕ⅰ号”、“宫外孕ⅱ号”方已成为全国中西医保守治疗宫外孕的经典处方 。勇于创新、不断探索是妇科多年来的一贯作风，在科主任孟渝梅带领下，他们积极走以中医为主、借鉴现代医学诊疗手段治疗疾病为特色的路子，在攻克妇产科疑难病症中，研制出专病专药制剂20余项，开创了中医妇科的新路 。其中“消炎栓”、“消糜栓”的研制获卫生部科研成果奖；“中药治疗外阴白斑”、“加味生化汤治疗子宫肌瘤”等研究先后获得省科研成果奖 。他们在妇科常见病、多发病、疑难病的治疗中开发研制出多种新药品种，如“苍柏止带颗粒剂”、“宫血宁冲剂”、“痛经冲剂”等，还结合西医疗法在治疗不孕症、子宫内膜异位症、功血、先兆流产、子宫肌瘤等方面取得了较好的疗效，尤其是对女阴白色病损的治疗具有独到之处 。
肝病研究所(肝病科)在曹月英主任的带领下，注重科研与临床双管齐下，提高了肝病特别是肝硬化腹水的治愈好转率 。他们针对我国肝炎发病率高的特点，研制出治疗急性肝炎的“急肝汤”、治疗乙型肝炎的“抗病毒胶囊”、退黄疸的“退黄胶囊”、治疗肝硬化的“强肝软坚汤”和“保肝精”等中药，为治疗肝病提供了有效的方法 。
消化科在调治胃肠疾病方面充分发挥出中医的特色，特别是目前治疗功能性胃肠疾病还没有特效药物，他们却有独到之处，通过辨证论治和综合调理，不仅使症状缓解，还可使紊乱的机能恢复正常 。他们研制出的全国第一个纯中药的胃动力药――胃逆康胶囊，获得山西省科技进步一等奖，现已列入国家基本用药 。他们研制的“消痞和胃胶囊”、“肠通灵胶囊”
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