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橘子中有虫子主要是被柑桔大实蝇侵入 。柑橘还小时，柑桔大实蝇把卵产在表皮上面，常温下，2到4天即可孵化，幼虫由果皮钻进果实内部取食，待发育到2龄幼虫、3龄老熟幼虫后，即从危害果实内钻出进入沙土内化蛹，钻入沙土约为5到10厘米深，直至翌年四月气候回暖，蛹从土壤中羽化为成虫，成虫再次产卵，孵化为幼虫，幼虫化踊，蛹再羽化，生命周而复始，延续了物种的存在 。
柑橘大实蝇：
【橘子里面有虫子是什么原因】柑橘大实蝇又名橘大实蝇，属双翅目，实蝇科，寡鬃实蝇亚科，俗称“柑蛆”，是柑橘的一种毁灭性害虫 。是危害柑桔、柚类的重要检疫害虫，也是国际检疫性害虫之一 。
柑橘大实蝇几乎危害芸香科柑橘属的所有果实，常见的寄主有甜橙、酸橙、柚、蜜橘、红橘、金橘、柠檬、佛手、胡柚、枸橘等 。
柑橘大实蝇1年只发生1代，1个世代有4个虫态，即卵、幼虫、蛹、成虫；卵期1个月左右，幼虫期3个月左右，蛹期6个月左右，成虫期50天左右 。成虫羽化出土产卵前有取食补充营养（趋糖性）的特性，常群集在柑橘园及附近的竹林内取食蚜虫等分泌的蜜露 。卵产于柑橘幼果内，卵在果内孵化后，以幼虫成群取食橘瓣 。幼虫老熟后随果实落地或在果实落地前爬出，入土化蛹 。越冬入土深度通常在土表下3-10厘米，以3-5厘米处最多 。
