二是因属于用人单位原因而耽误工伤认定申请的 。实践中，包括以下情形：（1）有不少职工工伤意识不强，一些用人单位有意欺骗受伤职工或者其近亲属，虽也给予受伤职工必要的治疗和支付一定的待遇，一旦超过法定申请期限，就撒手不管 。用人单位借故与职工协商申请工伤认定事宜，一旦超过法定申请期限，就不再协商 。用人单位在与职工协商过程中同意申请工伤认定，但一直拖延申请，导致职工超过申请期限的 。这些情形下一般用人单位大多未缴纳工伤保险费用 。因此，在理解工伤认定申请期限的问题上，要考虑到职工实际所处的弱势地位，对其申请权利进行充分保障，因属于用人单位原因而耽误工伤认定申请期限的，耽误的期限依法应当予以扣除 。
三是因社会保险行政部门登记制度不完善而耽误工伤认定申请的 。由于社会保险行政部门登记制度不完善，工伤申请人已申请工伤认定却无从查证，申请人有证据证明是因社会保险行政部门登记制度不完善导致的，被耽误的时间可以扣除或者中断计算 。
四是因双方当事人对是否存在劳动关系发生争议而申请仲裁、提起民事诉讼而耽误工伤认定申请的 。申请人申请劳动仲裁、提起民事诉讼程序确认劳动关系，是否属于申请期限的中断或者中止的事由？一种意见认为，不是中断或者中止事由 。申请人应先提出工伤认定申请，再通过民事诉讼或劳动仲裁确认劳动关系 。因为提起仲裁、民事诉讼，并不影响同时申请工伤认定，在社会保险行政部门受理申请人申请后，会要求其提供劳动关系的相关证据，申请人可以以正在仲裁或诉讼的理由要求延长举证期限 。另外，有人进一步认为，不应将其视为申请期限的中断或者中止事由的理由为：工伤补偿一定要及时，补偿及时到位，可以使职工得到更多的生存、康复的机会，可以避免职工及其家属的生活陷入困境 。如果认可中断事由，这实际上就大大推迟了职工得到工伤补偿的时间 。况且，工伤认定部门同样具备对劳动关系存在与否的认定能力，在工伤认定过程中，对劳动关系存在与否有争议，没有必要通过劳动仲裁来解决 。综上，不应将双方当事人对是否存在劳动关系发生争议而申请仲裁、提起诉讼视为申请期限的中断或者中止事由 。另一种意见认为，应该属于工伤认定申请期限中断或者中止的法定事由 。用人单位和劳动者之间存在劳动关系，是受伤职工认定为工伤的前提条件之一 。因为工伤认定是以确认劳动关系为基础的，劳动关系不存在也就不可能认定工伤了 。双方当事人因是否存在劳动关系发生争议而申请仲裁、提起民事诉讼而耽误的时间应当依法予以中断或者扣除，否则受伤职工或者其近亲属无法在申请工伤时提供《工伤保险条例》第十八条第一款第（二）项规定的 “与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料” 。我们认为，如果没有民事诉讼法等法律规定 “申请仲裁、提起民事诉讼”，社会保险行政部门在行使工伤认定职权中独自对劳动关系进行判断是最为理想的，也可以大大缩短职工得到工伤补偿的时间 。不过，由于民事诉讼法等法律明确规定对劳动关系可以申请仲裁、提起民事诉讼，工伤申请人可以在法定工伤认定申请期限内对劳动关系申请仲裁、提起民事诉讼 。因此，由此耽误的期限依法应当中断或者中止 。如《四川省高级人民法院关于审理工伤认定行政案件若干问题的意见》第十二条规定：“有下列情形之一的，人民法院应当认定劳动保障行政部门作出不予受理工伤认定申请的决定证据不足，适用法规错误：……（三）受伤害职工在工伤认定申请期限内向劳动和社会保障行政部门提出了工伤认定申请，但因劳动关系争议而申请仲裁或提起诉讼，致使其在劳动关系确认后再次提出工伤认定申请逾期的 。”
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