细菌是具有细胞结构的生物体；体积较病毒大，有细胞基本结构即细胞膜、细胞壁、细胞质和细胞核 ， 除此之外还有夹馍、鞭毛、菌毛等特殊结构 。
致病性不同：病毒是以靶器官为目标，具有吸附、转移和复制功能；当病毒感染人以后，将自身遗传物质转移到人体细胞内，然后进行自我复制，从而干扰了人体细胞的正常生命活动，造成细胞内的功能紊乱，甚至导致细胞裂解死亡 。
细菌是在微生物的培养基进行细菌繁殖；一方面细菌自身具有侵袭力 ， 即细菌突破皮肤、粘膜等屏障，进入机体内定值、繁殖以及扩散的能力，从而损伤人体 。另一方面细菌感染人体以后会不断释放毒素 。
为什么病毒比细菌难以消灭呢？
病毒的不可控因素：病毒强大的自我复制功能：病毒的特性是自我复制，而且病毒的复制能力非常强大，它是以病毒核酸为模板，在DNA或RNA及其他必要因素作用下 ， 合成了子代的病毒核酸和蛋白质，装配成完整病毒颗粒并释放到细胞外 。而所谓病毒复制经历了吸附、穿入、脱壳、合成及装配、释放的复杂过程，称为复制周期 。病毒的复制过程，而产生大量的子代病毒 ， 而此时，宿主细胞的生物合成则受到不同程度的抑制和破坏 。
抗病毒药物不能准确消灭、控制病毒：病毒体积微小 ， 通过宿主细胞转移、释放和复制病毒生存的，从而破坏了人的正常细胞 。所以人类在消灭病毒的同时 ， 往往就会“牺牲”人体细胞 。这就会出现“歼敌千人、自毁八百”的困难局面 。
而且有些病毒被消灭也许并不是病毒药物的“功劳”，是靠人体自身免疫力来对抗病毒，这就是我们常说的自限性 。所以，并不是所有的病毒，都有药物能够控制、消灭病毒的 。
病毒的变异：病毒变异是病毒的基因在某一序列片段的氨基酸发生了变化；病毒变异是病毒对外界环境变化的适应 ， 病毒变异非常正常，比如流感病毒几乎每一、二年都会有变异 ， 因此，当人们刚刚研制出预防病毒疫苗 ， 由于其变异，就使得疫苗的作用大打折扣 。
病毒具有免疫逃逸的特性：病毒能够通过各种方式使得人体免疫细胞不能发现病毒，当我们的免疫细胞、免疫组织、免疫器官还没有发现病毒存在的时候 ， 就不能启动免疫反应，而当免疫发生反应的时候 ， 往往病毒已经改变活动轨迹，逃逸到其他靶器官去了，不能有效病毒杀伤 。
细菌是依靠二分裂式的细胞分裂：
细菌是通过无性的二分裂方式进行细菌繁殖的，可以经过细胞核与细胞质分裂、延长 ， 形成横隔膜及细胞壁，最后子细胞从母细胞中分离的过程 。细菌的繁殖、分裂过程基本上是一种有规律的模式，因此 ， 一般抗菌素都能抵达，在细菌繁殖前 ， 人们利用抗生素将致病菌消灭 。
当然，人体内不是所有细菌都是有害的，我们的肠道内还有许多益生菌，可以帮助我们建立正常的菌群 ， 维持肠道正常生态平衡 。因此 ， 抗生素也是不能滥用的，否则就会人为的制造“超级细菌”，我们就诊断无药可用了 。
因此 ， 由于病毒具有强大自我复制功能、病毒的变异、逃逸能力，病毒无处不在、往往还需要人类自身免疫功能来控制病毒，使得我们在预防病毒和控制、消灭病毒方面面临着种种考验 。细菌由于其是靠分裂繁殖，需要一定的条件，相对于病毒是可以有抗生素控制的 。
因为病毒是比较复杂的，那么没有专门的药物来进行治疗的话，他是很难恢复的，而且也是很难消灭的，他跟细菌是不一样的
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