1、定义不同
本科教育（undergraduate education），高等教育的中级层次 。属联合国教科文组织《国际教育标准分类》的第三级第一阶段（授予大学第一级学位或同等学历证书）教育 。与专科教育、研究生教育构成高等教育内部的 3 个层次，为高等教育的主干部分 。
应用型本科指以应用型为办学定位，而不是以科研为办学定位的本科院校 。应用型本科教育对于满足中国经济社会发展，对高层次应用型人才需要以及推进中国高等教育大众化进程起到了积极的促进作用 。
2、包含范围不同
本科：在我国普通高考当中，本科录取分为本科一批（一本）、本科二批（二本）和本科三批（三本）（2017年部分地区取消本科三批） 。
【应用型本科和普通本科的区别是什么 应用型本科和普通本科有哪些不同】应用型本科：现阶段一般包括所有的本科第一批、本科第二批录取院校 。
3、招收对象不同
本科教育主要招收高中毕业生，学制依据不同专业，一般为4～5年；少量招收专科毕业生，一般要通过专升本考试，学制2年 。
“应用型本科”是对新型的本科教育和新层次的高职教育相结合的教育模式的探索，由部分省属本科院校与国家级示范性高等职业院校、国家大型骨干企业联合试点培养适应社会经济发展需求的应用型本科专业人才 。
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