绿色食品初次申报办理程序主要包括以下内容：
申请人至少在产品收获、屠宰或捕捞前三个月，向所在省级绿色食品工作机构提出申请，完成网上在线申报并提交相关材料 。
省级工作机构对申请人提交的材料进行材料审查并组织检查组完成现场检查 。
申请人委托绿色食品定点检测机构对产地环境、产品进行检测和评价 。和《绿色食品 产地环境调查、监测与评价规范》（NY/T1054）中免测条件的，省级工作机构可做出免做环境检测的决定 。）
省级工作机构完成初审后，将初审合格的材料上报中国绿色食品发展中心，同时完成网上报送 。
【绿色食品中绿色的含义是强调产品出自最佳的什么】中国绿色食品发展中心对省级工作机构报送的材料完成书面审查并组织召开专家评审会 。
中心主任根据专家评审意见做出颁证决定，中国绿色食品发展中心标志管理部门完成颁证工作 。
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