但进入新世纪后，随着开都河丰水期的结束和工农业用水的剧增 ， 博斯腾湖的水位和盐度开始反弹 。到2012年，博斯腾湖水位降至1045.06m，盐度增加到1.3g/L 。虽然近些年来，国家加大了生态环境保护的力度，博斯腾湖水体矿化的趋势得到遏制，但从湖泊类型上来看，仍然是 微咸水湖。
从水域面积上来说，南四湖和兴凯湖都比巢湖大 ， 并且不存在呼伦湖和博斯腾湖那样从淡水湖变成咸水湖的情况 ， 但各有各的“难处”，导致他们没能跻身中国五大淡水湖之列 。
首先来说南四湖 。准确的说，南四湖并不是一个湖，而是微山湖、昭阳湖、独山湖和南阳湖四个相连湖的总称 ，又因为微山湖在四湖中面积最大，习惯上称南四湖为微山湖 。
微山湖、昭阳湖、独山湖和南阳湖四湖都是明清时期，因京杭大运河疏浚工程而先后形成的湖泊 ， 虽然无明显界限，但因为四湖形成的时间和时代背景不同，所以在一般情况下，南四湖只能算作湖泊群的概念，而四湖中最大的微山湖，其水域面积为666km²，并没有超过巢湖的769km² 。
而位于东北中俄边境的兴凯湖，其水域面积高达4380km²，比鄱阳湖还要大，但因为 历史 原因，兴凯湖只有三分之一（1230km²）在中国 。一个并不完全属于中国的湖泊，自然也就没有算在五大淡水湖之内 。
综上所述 ， 将巢湖列为中国五大淡水湖之一并没有问题 。不过也有说法称 ， 将巢湖与鄱阳湖等列为长江流域五大淡水湖，或去除偏小的巢湖称中国四大淡水湖更为妥当 。
但我觉得 ， 无论是五大淡水湖还是四大淡水湖都没有多大意义，不过是一个名号 。我们更应该关注当下湖泊、湿地所面临的诸如湖水矿化、富营养化、泥沙淤积、湿地退化等生态问题，这远比“争名夺利”要重要的多 。
参考资料：
[1]李,马巍,史晓新,廖文根.呼伦湖水位、盐度变化(1961-2002年)
[2]王春峰.博斯腾湖水矿化度演变过程分析
[3]成正才,李宇安.博斯腾湖的水盐平衡与矿化度
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