也有人将纳豆和生鸡蛋、葱、茗荷、萝卜、柴鱼等各种食材一起混合 。
有时也将纳豆和砂糖混合 。亦有加上蛋黄酱的创意吃法 。
若未经搅拌便加入酱料会使水分过多，粘性也会有所消减 ，
葱和芥末则能抑制“纳豆氨”刺鼻的气味 。不习惯吃纳豆者则以为是腐坏的水煮黄豆 。
传统制法将蒸熟的黄豆用稻草包裹起来，稻草浸泡在100度的沸水中以杀菌消毒，
并保持在摄氏40度放置一日，稻草上常见的枯草杆菌（纳豆菌）因可产生芽孢而耐热度高，
杀菌过程不受破坏，高温培养速度快也能抑制其他菌种，并使黄豆发酵后产生黏稠的丝状物 ，
这种黏稠外观主要来自成分中的谷氨酸，被认为是纳豆美味的来源 。
利用蒸过的黄豆加上人工培养出的纳豆菌混合后，直接放在容器中使之发酵，
黄豆以外之某些食品亦能制成纳豆 。
而制作清酒时，原料的米中若不慎受纳豆菌沾染，以其快速的繁殖速度，
将抑制酿酒所需的酵母菌 。酿清酒处所不可出现纳豆，
其他发酵食品可能也有类似情况，制程需多加留意 。
纳豆菌属于弱酸性，会阻碍乳酸菌制造的乳酸 。在技术上已经开发出气味较弱的纳豆 ，
但由于使用了活发性较低的纳豆菌种，容易造成其他细菌的增殖空间 。
纳豆菌的天敌是会寄生在细菌上的噬菌体病毒，在噬菌体开始作用后会降低纳豆菌的活动力 ，
并可能造成其他细菌开始繁殖，因此应避免食用超过保存期限的纳豆 。
传统上先将纳豆加上酱油或日式芥末，搅拌至丝状物出现，置于白饭上食用，是为纳豆饭 。
也有人将纳豆和生鸡蛋、葱、茗荷、萝卜、柴鱼等各种食材一起混合 。
有时也将纳豆和砂糖混合 。亦有加上蛋黄酱的创意吃法 。
若未经搅拌便加入酱料会使水分过多，粘性也会有所消减，
葱和芥末则能抑制“纳豆氨”刺鼻的气味 。不习惯吃纳豆者则以为是腐坏的水煮黄豆 。
纳豆是由黄豆通过纳豆菌（枯草杆菌）发酵制成豆制品，具有黏性，气味较臭，味道微甜 。下面来看一道做纳豆的做法：
自制纳豆做法步骤
制作配料：黄豆240克 纳豆菌粉1包 白糖10克 温水10克
制作方法：
1、准备大约250克的黄豆，清洗干净之后清水浸泡1个晚上；
2、把黄豆完全泡发；
3、再把黄豆捞出来放在高压锅里蒸熟，大约蒸50分钟左右；没有高压锅，普通蒸锅大约需要2个小时左右；
4、按蹄筋豆类键煮；
5、煮熟的黄豆用手一捻就碎，这样的程度就可以；然后把黄豆凉至大约40度左右；
6、可以压力锅 ， 既能煮饭也能煲汤，还可以当压力锅使用，有自动排压的功能，中间随时可以添加蔬菜 。用这个锅做的米饭粒粒分明，煲汤食材软而不烂，压力锅压出的食材保留了原来的颜色和味道，营养也不流失，好看又实用！
7、10克左右的温水，加入纳豆菌粉化开，再倒入到黄豆碗里拌均匀（装黄豆的容器要提前消毒）；
8、盖上一块湿布，放在大约40度的环境里去发酵大约16-18个小时；发酵的时候把发酵门打开一丢丢 ， 不要把门关死；
9、发酵好的豆子表面有一层白霜，这样就差不多发酵好了；
10、用力搅拌，就会有很多的拉丝；
11、我们自制的纳豆就完成了，吃的时候加点酱油，小葱拌均匀就可以食用了 。经过发酵的黄豆也就是纳豆，是一种特别营养的食物 。家里只要有发酵的工具，比如发酵箱、酸奶机、烤箱的发酵功能其实都是可以做的，做法也相对简单 。
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